小林家別邸部分
皇后御学問所は皇后御座所と同様に、小林家別邸部分の建物です。一階部分と同様に、畳の縁は萌葱絹縁で、照明器具の赤い色は硝子に金を熔解して発色させた物です。室内の釘隠しは鶴の形をした物となっています。